Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SlirpQ9D8T7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SlirpQ9D8T7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms