Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms