Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms