Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TriobpQ99KW3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TriobpQ99KW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TriobpQ99KW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TriobpQ99KW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TriobpQ99KW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TriobpQ99KW3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms