Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorbQ8R1B8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RorbQ8R1B8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms