Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Defb12Q8K4N3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defb12Q8K4N3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defb12Q8K4N3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defb12Q8K4N3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Defb12Q8K4N3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Defb12Q8K4N3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms