Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hacd3Q8K2C9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms