Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClasrpQ8CFC7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ClasrpQ8CFC7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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