Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc30Q8BVF4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc30Q8BVF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc30Q8BVF4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms