Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik4Q8BMF5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms