Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptx4Q6RUU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptx4Q6RUU0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptx4Q6RUU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms