Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm29Q6PDI5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm29Q6PDI5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ecm29Q6PDI5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms