Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zbtb40Q6PCS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zbtb40Q6PCS8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbtb40Q6PCS8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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