Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Smchd1Q6P5D8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smchd1Q6P5D8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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