Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bfsp2Q6NVD9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bfsp2Q6NVD9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms