Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nup62Q63850 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms