Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim58Q5NCC9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim58Q5NCC9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim58Q5NCC9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms