Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC051142Q3V0M8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
BC051142Q3V0M8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC051142Q3V0M8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC051142Q3V0M8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BC051142Q3V0M8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BC051142Q3V0M8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC051142Q3V0M8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms