Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SfswapQ3USH5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SfswapQ3USH5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms