Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeblQ0II04 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeblQ0II04 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeblQ0II04 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeblQ0II04 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeblQ0II04 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeblQ0II04 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NeblQ0II04 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
NeblQ0II04 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeblQ0II04 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeblQ0II04 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeblQ0II04 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeblQ0II04 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeblQ0II04 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NeblQ0II04 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NeblQ0II04 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NeblQ0II04 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NeblQ0II04 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms