Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pate4Q09098 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pate4Q09098 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms