Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou2f2Q00196 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou2f2Q00196 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou2f2Q00196 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms