Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmc2P46471 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms