Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tacr1P30548 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms