Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnga1P29974 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cnga1P29974 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cnga1P29974 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms