Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kif3aP28741 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kif3aP28741 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms