Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PparaP23204 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PparaP23204 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PparaP23204 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PparaP23204 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PparaP23204 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PparaP23204 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PparaP23204 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PparaP23204 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PparaP23204 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PparaP23204 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PparaP23204 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PparaP23204 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PparaP23204 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PparaP23204 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PparaP23204 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PparaP23204 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PparaP23204 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PparaP23204 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PparaP23204 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PparaP23204 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PparaP23204 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PparaP23204 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PparaP23204 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PparaP23204 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PparaP23204 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PparaP23204 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PparaP23204 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PparaP23204 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PparaP23204 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms