Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpraP18052 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpraP18052 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpraP18052 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpraP18052 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpraP18052 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpraP18052 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpraP18052 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpraP18052 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpraP18052 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpraP18052 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpraP18052 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpraP18052 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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