Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01647 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01647 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01647 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01647 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01647 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01647 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01647 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
P01647 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01647 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01647 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01647 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01647 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01647 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01647 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01647 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
P01647 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01647 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01647 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01647 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01647 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P01647 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01647 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01647 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01647 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01647 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01647 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01647 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01647 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01647 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01647 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01647 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01647 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01647 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01647 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01647 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01647 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01647 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01647 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01647 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01647 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01647 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01647 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms