Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap6O54834 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap6O54834 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms