Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c3J3QJW5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms