Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r194J3JS27 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r194J3JS27 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms