Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4aF8VPX6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4aF8VPX6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms