Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep350E9Q309 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep350E9Q309 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cep350E9Q309 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep350E9Q309 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep350E9Q309 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep350E9Q309 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms