Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trappc8E9PWG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trappc8E9PWG2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trappc8E9PWG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms