Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3550W4VSN7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3550W4VSN7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3550W4VSN7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3550W4VSN7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3550W4VSN7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3550W4VSN7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3550W4VSN7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3550W4VSN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3550W4VSN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3550W4VSN7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3550W4VSN7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3550W4VSN7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3550W4VSN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3550W4VSN7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3550W4VSN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3550W4VSN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3550W4VSN7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3550W4VSN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3550W4VSN7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3550W4VSN7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3550W4VSN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3550W4VSN7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3550W4VSN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3550W4VSN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3550W4VSN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3550W4VSN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3550W4VSN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3550W4VSN7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3550W4VSN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3550W4VSN7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3550W4VSN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3550W4VSN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms