Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc8a3S4R2P9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc8a3S4R2P9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc8a3S4R2P9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc8a3S4R2P9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc8a3S4R2P9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc8a3S4R2P9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc8a3S4R2P9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc8a3S4R2P9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc8a3S4R2P9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc8a3S4R2P9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc8a3S4R2P9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc8a3S4R2P9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc8a3S4R2P9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc8a3S4R2P9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc8a3S4R2P9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc8a3S4R2P9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc8a3S4R2P9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc8a3S4R2P9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc8a3S4R2P9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc8a3S4R2P9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc8a3S4R2P9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc8a3S4R2P9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc8a3S4R2P9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc8a3S4R2P9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc8a3S4R2P9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc8a3S4R2P9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc8a3S4R2P9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc8a3S4R2P9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc8a3S4R2P9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc8a3S4R2P9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc8a3S4R2P9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc8a3S4R2P9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms