Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc22a4Q9Z306 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc22a4Q9Z306 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc22a4Q9Z306 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc22a4Q9Z306 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc22a4Q9Z306 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc22a4Q9Z306 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc22a4Q9Z306 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc22a4Q9Z306 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc22a4Q9Z306 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc22a4Q9Z306 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc22a4Q9Z306 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc22a4Q9Z306 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc22a4Q9Z306 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc22a4Q9Z306 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc22a4Q9Z306 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc22a4Q9Z306 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc22a4Q9Z306 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc22a4Q9Z306 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc22a4Q9Z306 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc22a4Q9Z306 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc22a4Q9Z306 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc22a4Q9Z306 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc22a4Q9Z306 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc22a4Q9Z306 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc22a4Q9Z306 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc22a4Q9Z306 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc22a4Q9Z306 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc22a4Q9Z306 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc22a4Q9Z306 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc22a4Q9Z306 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc22a4Q9Z306 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc22a4Q9Z306 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms