Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gria4Q9Z2W8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gria4Q9Z2W8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gria4Q9Z2W8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gria4Q9Z2W8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gria4Q9Z2W8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gria4Q9Z2W8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gria4Q9Z2W8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gria4Q9Z2W8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gria4Q9Z2W8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gria4Q9Z2W8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gria4Q9Z2W8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gria4Q9Z2W8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gria4Q9Z2W8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gria4Q9Z2W8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gria4Q9Z2W8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gria4Q9Z2W8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gria4Q9Z2W8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gria4Q9Z2W8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gria4Q9Z2W8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gria4Q9Z2W8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gria4Q9Z2W8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gria4Q9Z2W8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gria4Q9Z2W8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gria4Q9Z2W8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gria4Q9Z2W8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gria4Q9Z2W8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gria4Q9Z2W8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gria4Q9Z2W8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gria4Q9Z2W8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gria4Q9Z2W8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gria4Q9Z2W8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gria4Q9Z2W8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gria4Q9Z2W8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gria4Q9Z2W8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gria4Q9Z2W8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gria4Q9Z2W8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gria4Q9Z2W8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gria4Q9Z2W8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gria4Q9Z2W8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gria4Q9Z2W8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gria4Q9Z2W8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gria4Q9Z2W8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gria4Q9Z2W8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gria4Q9Z2W8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gria4Q9Z2W8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gria4Q9Z2W8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gria4Q9Z2W8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gria4Q9Z2W8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gria4Q9Z2W8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gria4Q9Z2W8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gria4Q9Z2W8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gria4Q9Z2W8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gria4Q9Z2W8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gria4Q9Z2W8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gria4Q9Z2W8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gria4Q9Z2W8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gria4Q9Z2W8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gria4Q9Z2W8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gria4Q9Z2W8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms