Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CcniQ9Z2V9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CcniQ9Z2V9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CcniQ9Z2V9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CcniQ9Z2V9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcniQ9Z2V9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcniQ9Z2V9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcniQ9Z2V9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcniQ9Z2V9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CcniQ9Z2V9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcniQ9Z2V9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcniQ9Z2V9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcniQ9Z2V9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcniQ9Z2V9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcniQ9Z2V9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CcniQ9Z2V9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcniQ9Z2V9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcniQ9Z2V9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcniQ9Z2V9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcniQ9Z2V9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcniQ9Z2V9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcniQ9Z2V9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcniQ9Z2V9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcniQ9Z2V9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcniQ9Z2V9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms