Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp5Q9Z2P8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp5Q9Z2P8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp5Q9Z2P8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp5Q9Z2P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp5Q9Z2P8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp5Q9Z2P8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp5Q9Z2P8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms