Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd2Q9Z2E1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd2Q9Z2E1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd2Q9Z2E1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mbd2Q9Z2E1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd2Q9Z2E1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mbd2Q9Z2E1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mbd2Q9Z2E1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd2Q9Z2E1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd2Q9Z2E1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd2Q9Z2E1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms