Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z211

Pex11a, Peroxisomal membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex11aQ9Z211 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pex11aQ9Z211 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pex11aQ9Z211 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pex11aQ9Z211 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pex11aQ9Z211 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pex11aQ9Z211 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pex11aQ9Z211 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pex11aQ9Z211 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pex11aQ9Z211 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Pex11aQ9Z211 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pex11aQ9Z211 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pex11aQ9Z211 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pex11aQ9Z211 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pex11aQ9Z211 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pex11aQ9Z211 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pex11aQ9Z211 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pex11aQ9Z211 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pex11aQ9Z211 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pex11aQ9Z211 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pex11aQ9Z211 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pex11aQ9Z211 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pex11aQ9Z211 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pex11aQ9Z211 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pex11aQ9Z211 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pex11aQ9Z211 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pex11aQ9Z211 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pex11aQ9Z211 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pex11aQ9Z211 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pex11aQ9Z211 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pex11aQ9Z211 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pex11aQ9Z211 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pex11aQ9Z211 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pex11aQ9Z211 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pex11aQ9Z211 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pex11aQ9Z211 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pex11aQ9Z211 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pex11aQ9Z211 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pex11aQ9Z211 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pex11aQ9Z211 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pex11aQ9Z211 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pex11aQ9Z211 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pex11aQ9Z211 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pex11aQ9Z211 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pex11aQ9Z211 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pex11aQ9Z211 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pex11aQ9Z211 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pex11aQ9Z211 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pex11aQ9Z211 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pex11aQ9Z211 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pex11aQ9Z211 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pex11aQ9Z211 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pex11aQ9Z211 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pex11aQ9Z211 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pex11aQ9Z211 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms