Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngr4Q9Z1L2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngr4Q9Z1L2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngr4Q9Z1L2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngr4Q9Z1L2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr4Q9Z1L2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngr4Q9Z1L2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngr4Q9Z1L2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngr4Q9Z1L2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr4Q9Z1L2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr4Q9Z1L2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr4Q9Z1L2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr4Q9Z1L2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngr4Q9Z1L2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngr4Q9Z1L2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngr4Q9Z1L2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr4Q9Z1L2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr4Q9Z1L2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngr4Q9Z1L2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngr4Q9Z1L2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngr4Q9Z1L2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngr4Q9Z1L2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syngr4Q9Z1L2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngr4Q9Z1L2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr4Q9Z1L2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngr4Q9Z1L2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngr4Q9Z1L2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr4Q9Z1L2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr4Q9Z1L2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr4Q9Z1L2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms