Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J1

Tcf7l1, Transcription factor 7-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7l1Q9Z1J1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf7l1Q9Z1J1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf7l1Q9Z1J1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf7l1Q9Z1J1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf7l1Q9Z1J1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf7l1Q9Z1J1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf7l1Q9Z1J1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcf7l1Q9Z1J1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcf7l1Q9Z1J1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf7l1Q9Z1J1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf7l1Q9Z1J1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcf7l1Q9Z1J1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcf7l1Q9Z1J1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcf7l1Q9Z1J1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms