Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Itsn2Q9Z0R6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Itsn2Q9Z0R6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Itsn2Q9Z0R6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Itsn2Q9Z0R6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Itsn2Q9Z0R6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Itsn2Q9Z0R6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Itsn2Q9Z0R6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Itsn2Q9Z0R6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Itsn2Q9Z0R6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Itsn2Q9Z0R6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Itsn2Q9Z0R6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Itsn2Q9Z0R6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Itsn2Q9Z0R6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Itsn2Q9Z0R6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Itsn2Q9Z0R6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Itsn2Q9Z0R6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Itsn2Q9Z0R6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Itsn2Q9Z0R6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Itsn2Q9Z0R6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Itsn2Q9Z0R6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Itsn2Q9Z0R6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Itsn2Q9Z0R6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Itsn2Q9Z0R6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Itsn2Q9Z0R6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Itsn2Q9Z0R6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Itsn2Q9Z0R6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Itsn2Q9Z0R6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Itsn2Q9Z0R6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Itsn2Q9Z0R6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Itsn2Q9Z0R6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Itsn2Q9Z0R6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Itsn2Q9Z0R6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Itsn2Q9Z0R6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Itsn2Q9Z0R6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Itsn2Q9Z0R6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Itsn2Q9Z0R6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Itsn2Q9Z0R6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Itsn2Q9Z0R6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Itsn2Q9Z0R6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Itsn2Q9Z0R6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Itsn2Q9Z0R6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Itsn2Q9Z0R6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Itsn2Q9Z0R6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Itsn2Q9Z0R6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Itsn2Q9Z0R6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Itsn2Q9Z0R6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Itsn2Q9Z0R6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Itsn2Q9Z0R6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Itsn2Q9Z0R6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Itsn2Q9Z0R6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Itsn2Q9Z0R6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Itsn2Q9Z0R6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Itsn2Q9Z0R6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Itsn2Q9Z0R6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Itsn2Q9Z0R6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Itsn2Q9Z0R6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Itsn2Q9Z0R6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Itsn2Q9Z0R6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Itsn2Q9Z0R6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Itsn2Q9Z0R6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Itsn2Q9Z0R6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Itsn2Q9Z0R6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Itsn2Q9Z0R6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Itsn2Q9Z0R6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Itsn2Q9Z0R6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Itsn2Q9Z0R6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Itsn2Q9Z0R6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Itsn2Q9Z0R6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Itsn2Q9Z0R6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Itsn2Q9Z0R6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Itsn2Q9Z0R6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Itsn2Q9Z0R6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Itsn2Q9Z0R6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Itsn2Q9Z0R6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms