Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Itsn1Q9Z0R4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Itsn1Q9Z0R4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Itsn1Q9Z0R4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Itsn1Q9Z0R4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Itsn1Q9Z0R4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Itsn1Q9Z0R4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
Itsn1Q9Z0R4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Itsn1Q9Z0R4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Itsn1Q9Z0R4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Itsn1Q9Z0R4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Itsn1Q9Z0R4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Itsn1Q9Z0R4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Itsn1Q9Z0R4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Itsn1Q9Z0R4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Itsn1Q9Z0R4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Itsn1Q9Z0R4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Itsn1Q9Z0R4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Itsn1Q9Z0R4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Itsn1Q9Z0R4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Itsn1Q9Z0R4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Itsn1Q9Z0R4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Itsn1Q9Z0R4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Itsn1Q9Z0R4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Itsn1Q9Z0R4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Itsn1Q9Z0R4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Itsn1Q9Z0R4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Itsn1Q9Z0R4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Itsn1Q9Z0R4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Itsn1Q9Z0R4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Itsn1Q9Z0R4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Itsn1Q9Z0R4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Itsn1Q9Z0R4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Itsn1Q9Z0R4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Itsn1Q9Z0R4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Itsn1Q9Z0R4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Itsn1Q9Z0R4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Itsn1Q9Z0R4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Itsn1Q9Z0R4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Itsn1Q9Z0R4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Itsn1Q9Z0R4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Itsn1Q9Z0R4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Itsn1Q9Z0R4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Itsn1Q9Z0R4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Itsn1Q9Z0R4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Itsn1Q9Z0R4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Itsn1Q9Z0R4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Itsn1Q9Z0R4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Itsn1Q9Z0R4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Itsn1Q9Z0R4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Itsn1Q9Z0R4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Itsn1Q9Z0R4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Itsn1Q9Z0R4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Itsn1Q9Z0R4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Itsn1Q9Z0R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Itsn1Q9Z0R4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Itsn1Q9Z0R4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Itsn1Q9Z0R4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Itsn1Q9Z0R4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Itsn1Q9Z0R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Itsn1Q9Z0R4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Itsn1Q9Z0R4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Itsn1Q9Z0R4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Itsn1Q9Z0R4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Itsn1Q9Z0R4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Itsn1Q9Z0R4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Itsn1Q9Z0R4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Itsn1Q9Z0R4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Itsn1Q9Z0R4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Itsn1Q9Z0R4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Itsn1Q9Z0R4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Itsn1Q9Z0R4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Itsn1Q9Z0R4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Itsn1Q9Z0R4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Itsn1Q9Z0R4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Itsn1Q9Z0R4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms