Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clcn5Q9WVD4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn5Q9WVD4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn5Q9WVD4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn5Q9WVD4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn5Q9WVD4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clcn5Q9WVD4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn5Q9WVD4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clcn5Q9WVD4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clcn5Q9WVD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn5Q9WVD4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn5Q9WVD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn5Q9WVD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn5Q9WVD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Clcn5Q9WVD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clcn5Q9WVD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clcn5Q9WVD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clcn5Q9WVD4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clcn5Q9WVD4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clcn5Q9WVD4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clcn5Q9WVD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clcn5Q9WVD4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Clcn5Q9WVD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clcn5Q9WVD4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clcn5Q9WVD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Clcn5Q9WVD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clcn5Q9WVD4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clcn5Q9WVD4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clcn5Q9WVD4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clcn5Q9WVD4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clcn5Q9WVD4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clcn5Q9WVD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clcn5Q9WVD4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clcn5Q9WVD4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clcn5Q9WVD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clcn5Q9WVD4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clcn5Q9WVD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clcn5Q9WVD4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clcn5Q9WVD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clcn5Q9WVD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clcn5Q9WVD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clcn5Q9WVD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clcn5Q9WVD4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clcn5Q9WVD4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clcn5Q9WVD4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clcn5Q9WVD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clcn5Q9WVD4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn5Q9WVD4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clcn5Q9WVD4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn5Q9WVD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clcn5Q9WVD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn5Q9WVD4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn5Q9WVD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn5Q9WVD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn5Q9WVD4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Clcn5Q9WVD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn5Q9WVD4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms