Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gabbr1Q9WV18 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gabbr1Q9WV18 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gabbr1Q9WV18 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gabbr1Q9WV18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gabbr1Q9WV18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gabbr1Q9WV18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gabbr1Q9WV18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gabbr1Q9WV18 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gabbr1Q9WV18 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gabbr1Q9WV18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gabbr1Q9WV18 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gabbr1Q9WV18 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gabbr1Q9WV18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gabbr1Q9WV18 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gabbr1Q9WV18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gabbr1Q9WV18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabbr1Q9WV18 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabbr1Q9WV18 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabbr1Q9WV18 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gabbr1Q9WV18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gabbr1Q9WV18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gabbr1Q9WV18 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gabbr1Q9WV18 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabbr1Q9WV18 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gabbr1Q9WV18 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gabbr1Q9WV18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gabbr1Q9WV18 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gabbr1Q9WV18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gabbr1Q9WV18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gabbr1Q9WV18 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gabbr1Q9WV18 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gabbr1Q9WV18 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gabbr1Q9WV18 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gabbr1Q9WV18 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gabbr1Q9WV18 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gabbr1Q9WV18 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gabbr1Q9WV18 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gabbr1Q9WV18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gabbr1Q9WV18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gabbr1Q9WV18 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gabbr1Q9WV18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gabbr1Q9WV18 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gabbr1Q9WV18 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabbr1Q9WV18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gabbr1Q9WV18 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gabbr1Q9WV18 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gabbr1Q9WV18 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gabbr1Q9WV18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gabbr1Q9WV18 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gabbr1Q9WV18 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gabbr1Q9WV18 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gabbr1Q9WV18 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gabbr1Q9WV18 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gabbr1Q9WV18 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms