Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lbx2Q9WUN8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lbx2Q9WUN8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lbx2Q9WUN8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lbx2Q9WUN8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lbx2Q9WUN8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lbx2Q9WUN8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lbx2Q9WUN8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lbx2Q9WUN8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lbx2Q9WUN8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lbx2Q9WUN8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lbx2Q9WUN8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lbx2Q9WUN8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lbx2Q9WUN8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lbx2Q9WUN8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lbx2Q9WUN8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lbx2Q9WUN8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lbx2Q9WUN8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lbx2Q9WUN8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lbx2Q9WUN8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lbx2Q9WUN8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lbx2Q9WUN8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lbx2Q9WUN8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lbx2Q9WUN8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lbx2Q9WUN8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lbx2Q9WUN8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lbx2Q9WUN8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lbx2Q9WUN8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lbx2Q9WUN8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lbx2Q9WUN8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lbx2Q9WUN8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lbx2Q9WUN8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lbx2Q9WUN8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lbx2Q9WUN8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lbx2Q9WUN8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lbx2Q9WUN8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lbx2Q9WUN8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lbx2Q9WUN8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lbx2Q9WUN8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lbx2Q9WUN8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lbx2Q9WUN8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lbx2Q9WUN8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lbx2Q9WUN8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lbx2Q9WUN8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159 ms